NWChem
NWChem, Pacific Northwest Ulusal Laboratuvarı tarafından geliştirilen ücretsiz ve açık kaynaklı bir hesaplamalı kimya yazılımıdır. Kuantum kimyası, moleküler dinamik ve karma QM/MM hesaplamaları için kapsamlı araçlar sunar. Yüksek performanslı paralel hesaplama için MPI desteği içerir. Öncelikli olarak Linux ve macOS için geliştirilmiştir; Windows için deneysel destek mevcuttur. ECL-2.0 lisansıyla açık kaynaklıdır.
Temel Özellikler
- DFT, HF, MP2, CCSD(T) gibi kuantum kimya yöntemlerini destekler
- Ab initio moleküler dinamik simülasyonu yapabilir
- QM/MM karma hesaplamaları için araçlar içerir
- Paralel MPI altyapısıyla yüksek ölçeklenebilirlik sağlar
- Geniş temel set kütüphanesi mevcuttur
- Periyodik sistemler için özel hesaplama modülleri içerir
- Gaussian, NBO ve diğer popüler araçlarla çıktı uyumluluğu sağlar
- ECL-2.0 lisansıyla ücretsiz ve açık kaynaklıdır
NWChem ne için kullanılır, kimler tercih eder?
NWChem; kimya, fizik ve malzeme bilimi alanlarındaki araştırmacılar tarafından moleküler enerji hesapları, geometri optimizasyonu, titreşim frekans analizi ve reaksiyon mekanizması araştırmaları için kullanılır. Süper bilgisayar kümeleri üzerinde ölçeklenebilmesi büyük moleküler sistemler için avantajlıdır. Bireysel kullanıcılar için ORCA veya PSI4 gibi alternatifler daha kolay kurulum sunabilir.
NWChem Windows’ta nasıl çalıştırılır?
NWChem’in yerel Windows desteği sınırlıdır ve deneysel aşamadadır. En pratik yol WSL2 (Windows Subsystem for Linux) üzerinde Ubuntu kurarak NWChem’i Linux paket deposundan yüklemektir. “sudo apt install nwchem” komutuyla kurulum yapılabilir. Alternatif olarak Conda aracılığıyla çeşitli platformlarda kurmak mümkündür.
NWChem alternatifleri
Hesaplamalı kimya yazılımları: GROMACS, LAMMPS, PyMOL.
- Kapsamlı kuantum kimyası yöntemleri
- Yüksek performanslı paralel hesaplama (MPI)
- DFT'den post-HF yöntemlere geniş kapsam
- Ücretsiz ve açık kaynak
- Geniş temel set ve ECP kütüphanesi
- Conda aracılığıyla kolay kurulum
- Windows için yerel binary dağıtımı yoktur
- Grafik arayüz bulunmamaktadır
- Giriş dosyası sözdizimi karmaşık
- Diğer yazılımlara kıyasla daha az kullanıcı topluluğu
NWChem Tutorial Introduction
Computational Chemistry with NWChem
İşletim Sistemi: Linux, macOS (Windows için WSL önerilir)
RAM: 4 GB minimum (büyük hesaplamalar için 32 GB+)
Disk: 2 GB
Diğer: MPI kütüphanesi, Fortran derleyici (kaynak derlemede)